安徽省最好的理科大学是中国科学技术大学，全国理科综合实力排名第七位，是中国最好的大学之一。中国科学技术大学最好的学科是理学，全国排在第三位；工学也好可以，在全国第十五名附近。
    虽然中国未来5-10年的重大发明很可能出现在中科大，但是中科大的综合实力在全国不起眼。大学比的是综合实力，而不仅仅是单科的力量，著名大学更是这样。中科大只有理学和工学还可以，其他学科都没有或者很一般。农学、医学、哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学都没有，管理学算还可以。所以比较综合实力，中国科大是很吃亏的，或者说不理想。如果要比较，中国科大应在理工科行列，说白了中科大就是理工科大学。
   合肥工业大学也是非常好的理科大学，全国985工程大学。

说明：
    大学理科（自然科学）是理学、工学、农学、医学4个学科的统称，也就是每年高考中的理科。
    理学包括数学、物理学、化学、生物科学、天文学、地质学、地理科学、地球物理学、大气科学、海洋科学、力学、电子信息科学、材料科学、环境科学、心理学、统计学等16个学科类，共有31个本科专业。
    工学包括地矿、材料、机械、仪器仪表、能源动力、电气信息、土建、水利、测绘、环境与安全、化工与制药、交通运输、海洋工程、轻工纺织食品、航空航天、武器、工程力学、生物工程、农业工程、林业工程、公安技术等21个学科类，共有79个本科专业。
    农学包括植物生产、草业科学、森林资源、环境生态、动物生产、动物医学、水产等7个学科类，共有16个本科专业。
    医学包括基础医学、预防医学、临床医学与医学技术、口腔医学、中医学、法医学、护理学、药学等8个学科类，共有16个本科专业。